41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0068 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  100 
 
 
239 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  30.3 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  32.08 
 
 
235 aa  115  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  26.89 
 
 
240 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  30.23 
 
 
244 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  26.05 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.66 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  26.7 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  27 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  25.81 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  24.89 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  24.89 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  25.93 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  27.19 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  23.13 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.28 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.91 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  28.37 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  22.69 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  24.73 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  26.48 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  20.69 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  23.08 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  31.73 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  25.88 
 
 
232 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  23 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  21.03 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  23.04 
 
 
847 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  19.23 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  32.11 
 
 
280 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  23.47 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  19.55 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  27.2 
 
 
308 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  22.41 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>