More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0035 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0035  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.95 
 
 
254 aa  288  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.549848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05265  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.97 
 
 
250 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
266 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
266 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 
268 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.48 
 
 
263 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 
261 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
266 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
266 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  30.84 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  28.99 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4528  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0222933  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.954911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.98 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.29 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  25.94 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  28.78 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.47 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.47 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  25.52 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  25.52 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.95 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.36 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  25.52 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  27.35 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.32 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  27.72 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  27.15 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3468  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364811  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.6 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  24.69 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  24.27 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  24.27 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  27.98 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.64 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0425  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  26.03 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5238  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  normal  0.97533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3129  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5034  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  27.37 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  27.37 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  26.04 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4066  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  27.32 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000891346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.21 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  27.56 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3664  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705793  hitchhiker  0.000000000357336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1775  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  27.32 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  hitchhiker  0.0077103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  28.95 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  25.37 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.86 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.4 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4586  enoyl-CoA hydratase  33.54 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.612429 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05273  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A lyase/3-methylglutaconyl-coenzyme A hydratase (EC 4.1.3.4)(EC 4.2.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6S014]  27.54 
 
 
599 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347874  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  28.04 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.92 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  25.73 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5119  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21776  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.48 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.61 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.76 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.59 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.61 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  25.57 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>