191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0017 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  61.5 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  59.46 
 
 		 192 aa  240  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  55.85 
 
 		 189 aa  208  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  54.3 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  53.44 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  54.21 
 
 		 195 aa  204  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  52.38 
 
 		 192 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  54.5 
 
 		 189 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  51.06 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  49.73 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  50.27 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  50.52 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  47.62 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  49.46 
 
 		 191 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  49.2 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  49.2 
 
 		 187 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  48.66 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  51.35 
 
 		 188 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  46.56 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  40.96 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.94 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  41.94 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  38.17 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  52.94 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  59.42 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  52.94 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  55.22 
 
 		 69 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.7 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  52.94 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  50 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.67 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.59 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  46.48 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.05 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  48.53 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  50 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  50 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  51.39 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  48.53 
 
 		 99 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  50 
 
 		 73 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  43.16 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  51.39 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.16 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  55.07 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  46.38 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.68 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  49.3 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.68 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  47.76 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.43 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  49.25 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  52.17 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  46.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  39.6 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  45.33 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.06 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  47.76 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  41.46 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 117 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.74 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  46.38 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  44.74 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.74 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.02 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  47.76 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.04 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.53 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  45.33 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  46.38 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.53 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.38 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.71 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.9 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  41.33 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.21 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  41.38 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  48.57 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  49.21 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>