19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0009 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3508  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  72.06 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349505  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  58.62 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6581  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.75 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2904  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.76 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.953268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1599  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.95 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.324886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1046  hypothetical protein  57.35 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746008  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.05 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  40 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0047  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.3 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.1 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0046  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.86 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1627  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  41.46 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.339725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1250  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.67 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1125  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.786271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0615  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.635707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>