More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1989 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  857    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  55.13 
 
 
425 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  54.05 
 
 
428 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  54.37 
 
 
425 aa  488  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  53.65 
 
 
430 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 
428 aa  342  5e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 
421 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  40.14 
 
 
422 aa  299  5e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  35.54 
 
 
421 aa  278  1e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  39.49 
 
 
411 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
429 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  37.23 
 
 
397 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  37.17 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.09 
 
 
410 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  35.95 
 
 
411 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.11 
 
 
432 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 
414 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.42 
 
 
433 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
433 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
433 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
433 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
432 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 
635 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
642 aa  201  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  34.19 
 
 
635 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
630 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
635 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
635 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
635 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 
422 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
635 aa  192  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  30.75 
 
 
422 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 
636 aa  192  8e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
639 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 
635 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
426 aa  189  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.91 
 
 
629 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  32.81 
 
 
634 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
640 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  31.03 
 
 
637 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 
634 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 
635 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
821 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  31.08 
 
 
636 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.32 
 
 
647 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
640 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
421 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.98 
 
 
644 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
830 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.02 
 
 
636 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  29.31 
 
 
644 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
454 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  31.28 
 
 
454 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
641 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  31.52 
 
 
452 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.06 
 
 
455 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
646 aa  162  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  27.73 
 
 
767 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
461 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  28.39 
 
 
484 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
515 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.45 
 
 
467 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.34 
 
 
455 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
455 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
457 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
667 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  30.25 
 
 
447 aa  153  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  29.91 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
536 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
455 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  29.38 
 
 
452 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 
641 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
468 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28 
 
 
471 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.38 
 
 
465 aa  150  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 
577 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
634 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  28.96 
 
 
813 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
470 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  28.93 
 
 
452 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
465 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
467 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.51 
 
 
466 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.34 
 
 
540 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  29.07 
 
 
452 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
464 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 
467 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 
460 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  26.61 
 
 
602 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
465 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
460 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  28.69 
 
 
468 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  28.48 
 
 
455 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.43 
 
 
466 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.21 
 
 
452 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>