21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1901 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1901  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.332563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2250  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.91 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.105243  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1712  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.91 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0116  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.51 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.7 
 
 		 491 aa  62.4  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1898  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.32 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.108493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.49 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.55 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1164  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.93 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.605795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  25.93 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  34.23 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1727  uroporphyrinogen III synthase  23 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.198295  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1761  uroporphyrinogen III synthase  23 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.71 
 
 		 504 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  24.51 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.98 
 
 		 504 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.71 
 
 		 490 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.12 
 
 		 546 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.8 
 
 		 506 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.3 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1233  uroporphyrinogen-III synthase  23.38 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0133688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>