33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1865 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  43.48 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  46.09 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  41.28 
 
 
118 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  40.74 
 
 
116 aa  84  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  42.5 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  39.52 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  39.69 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  39.67 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  37.5 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  42.27 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  45.74 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  42.22 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  38.24 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  39 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  40.43 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  38.24 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  37.59 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  40.32 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  36.36 
 
 
580 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  36.36 
 
 
580 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  35.78 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  38.04 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  30.93 
 
 
580 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  26.61 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  27.27 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  28.57 
 
 
576 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  25.93 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  25.93 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  25.93 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>