163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1816 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
123 aa  253  8e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.53 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  34.41 
 
 
342 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  30.28 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  34.41 
 
 
342 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 
145 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  31.58 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 
345 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  38.27 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  28.18 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  32.73 
 
 
370 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  26.73 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.68 
 
 
404 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  35.8 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  34.12 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  42.11 
 
 
119 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 
104 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  37.84 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  25.66 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  32.35 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  25.66 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36.25 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 
348 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.9 
 
 
404 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  25.66 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  25.66 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  24.78 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  32 
 
 
408 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 
348 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 
294 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  30.14 
 
 
389 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 
351 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  35.71 
 
 
484 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
398 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  32.93 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  30.68 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  38.89 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  32.61 
 
 
353 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  37.68 
 
 
480 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
334 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.43 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  28.71 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  29.67 
 
 
331 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  27.47 
 
 
330 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  33.33 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
403 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  38.89 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 
345 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.88 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 
345 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>