More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1813 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  950    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  56.38 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.54 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  28.7 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  28 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  28.6 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  28.6 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  28.6 
 
 		 489 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 499 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  25.99 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.14 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  23.21 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 460 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.23 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.15 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  26.32 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.43 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  27.2 
 
 		 445 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.9 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.6 
 
 		 463 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.44 
 
 		 493 aa  87.4  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 441 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  26.03 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  27.8 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  27.48 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  22.25 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25.68 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  24.71 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  23.4 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.68 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  26.47 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  25.44 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.98 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  24.12 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  27 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  24.87 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  23.44 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  23.89 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.72 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  24.07 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  24.07 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  22.55 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  25.98 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.13 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.92 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  24.81 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  25.82 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  22.61 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  25.3 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.92 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>