More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1800 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2862  glycerol kinase  62.06 
 
 
499 aa  649    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1800  glycerol kinase  100 
 
 
532 aa  1087    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  0.482844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  68.73 
 
 
523 aa  740    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  60.94 
 
 
496 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  60.16 
 
 
496 aa  621  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  59.53 
 
 
497 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  57.83 
 
 
501 aa  588  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  56.59 
 
 
505 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  57.23 
 
 
498 aa  590  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  56.84 
 
 
494 aa  578  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  56.95 
 
 
489 aa  579  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  55.13 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  55.17 
 
 
500 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  54.1 
 
 
507 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  54.97 
 
 
500 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  53.37 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  53.37 
 
 
496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  53.37 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  53.57 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  54.31 
 
 
494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  53.37 
 
 
496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  53.17 
 
 
496 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  53.37 
 
 
496 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  53.17 
 
 
496 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  53.07 
 
 
496 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  53.77 
 
 
496 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  52.63 
 
 
505 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.17 
 
 
498 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  53.71 
 
 
497 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  53.68 
 
 
503 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1065  glycerol kinase  52.8 
 
 
500 aa  555  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000150653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.7 
 
 
502 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.17 
 
 
498 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.58 
 
 
502 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  52.83 
 
 
500 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  51.61 
 
 
513 aa  552  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  52.83 
 
 
500 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.98 
 
 
499 aa  549  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  51.42 
 
 
527 aa  548  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  52.63 
 
 
500 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  52.8 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  54.21 
 
 
496 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.8 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.8 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  52.43 
 
 
498 aa  548  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  52.63 
 
 
500 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.8 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  52.63 
 
 
500 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.11 
 
 
502 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  52.63 
 
 
500 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.3 
 
 
520 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  52.8 
 
 
507 aa  545  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  53.32 
 
 
498 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  54.55 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.24 
 
 
503 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.44 
 
 
496 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.24 
 
 
503 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  54.55 
 
 
494 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  53.32 
 
 
497 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  53.24 
 
 
496 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  52.83 
 
 
501 aa  547  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.24 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.24 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  54.35 
 
 
494 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.24 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.24 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.24 
 
 
518 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1916  glycerol kinase  55.29 
 
 
496 aa  544  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0267705  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  51.05 
 
 
510 aa  544  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  52.54 
 
 
495 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  51.95 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  54.35 
 
 
494 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  52.32 
 
 
509 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  53.25 
 
 
494 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  52.35 
 
 
499 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  52.57 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  53.24 
 
 
499 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  53.05 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  53.56 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  51.93 
 
 
502 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  53.03 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  53.42 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  53.36 
 
 
494 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  52.16 
 
 
499 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.23 
 
 
505 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  53.24 
 
 
503 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  52.16 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  52.75 
 
 
493 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  53.24 
 
 
505 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  52.93 
 
 
496 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>