145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1794 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  100 
 
 		 311 aa  638    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  42.17 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.11 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  28.21 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 434 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 873 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  20.94 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  27.04 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  21.75 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  25.15 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 782 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  24.53 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  19.79 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.66 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.97 
 
 		 778 aa  56.2  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.03 
 
 		 378 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  22.93 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  34.58 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 433 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 515 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25 
 
 		 479 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  21.35 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.35 
 
 		 371 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 365 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 501 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.39 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.07 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.94 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  31.58 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.23 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.04 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  20.82 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 468 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.19 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  21.81 
 
 		 354 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.19 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.58 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 401 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 843 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>