More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1789 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  88.64 
 
 		 415 aa  723    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 412 aa  821    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  68.25 
 
 		 407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  43.56 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  45.02 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  43.8 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  43.07 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  42.26 
 
 		 414 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  42.42 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  41.58 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  44.44 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  41.75 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  42.11 
 
 		 413 aa  319  7e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  43.47 
 
 		 408 aa  318  9e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  41.34 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  42.46 
 
 		 408 aa  312  9e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  41.44 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  41.65 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  38.65 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  40.59 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  40.4 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.72 
 
 		 404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  35.5 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  37.01 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  37.05 
 
 		 405 aa  235  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  36.34 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  38.54 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  37.25 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.43 
 
 		 650 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  35.16 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  36.14 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.03 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  34.72 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  35.78 
 
 		 399 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  32.7 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35 
 
 		 646 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  34.63 
 
 		 400 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  32.94 
 
 		 396 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  32.94 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  34 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  32.94 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  36.43 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  34 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  34.33 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  34.81 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 		 397 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  32.68 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  34.06 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  34.16 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  34.72 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.94 
 
 		 655 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  35.54 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  34.53 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  33.98 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  34.66 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  33.81 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  32.43 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  32.67 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  30.86 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2736  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  34.15 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  33.98 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  32.68 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  32.67 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  32.67 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  32.52 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1551  Phosphoglycerate kinase  34.3 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2700  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2199  Phosphoglycerate kinase  32.92 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000332645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  32.77 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1398  Phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>