More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1649 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.1 
 
 
216 aa  218  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.18 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.79 
 
 
191 aa  210  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.31 
 
 
194 aa  209  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.05 
 
 
211 aa  207  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.82 
 
 
193 aa  203  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.41 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.46 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.94 
 
 
192 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.7 
 
 
219 aa  175  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  46.2 
 
 
206 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  44.21 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.06 
 
 
210 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.49 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.04 
 
 
211 aa  161  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.86 
 
 
196 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  48.48 
 
 
189 aa  158  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.26 
 
 
254 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.65 
 
 
206 aa  158  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0748398  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.13 
 
 
221 aa  157  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.29 
 
 
209 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.78 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  44.75 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.75 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.36 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.56 
 
 
304 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.35 
 
 
202 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  43.26 
 
 
195 aa  151  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.08 
 
 
264 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  43.23 
 
 
292 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.31 
 
 
193 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.78 
 
 
199 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.31 
 
 
193 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.7 
 
 
243 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
187 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.78 
 
 
217 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.56 
 
 
264 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.33 
 
 
186 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
294 aa  148  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.05 
 
 
433 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  41.94 
 
 
213 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.81 
 
 
210 aa  147  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.16 
 
 
203 aa  147  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  41.99 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.86 
 
 
380 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.51 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  41.44 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.51 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  44.51 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  44.51 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.75 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  44.51 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.51 
 
 
455 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.38 
 
 
200 aa  145  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.34 
 
 
341 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.22 
 
 
276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  44.51 
 
 
220 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  42.78 
 
 
213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.45 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.76 
 
 
195 aa  144  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.89 
 
 
231 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1195  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.34 
 
 
258 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.26 
 
 
264 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.21 
 
 
249 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
295 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
205 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.51 
 
 
263 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.39 
 
 
189 aa  141  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.62 
 
 
305 aa  141  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.42 
 
 
277 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.18 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.24 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.39 
 
 
342 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.62 
 
 
358 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.13 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.1 
 
 
282 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.89 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.39 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.62 
 
 
367 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.39 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.38 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.58 
 
 
285 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.03 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.78 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.67 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.71 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.26 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  42.33 
 
 
264 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.37 
 
 
277 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.49 
 
 
294 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.49 
 
 
207 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.44 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  37.62 
 
 
260 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
255 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.94 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.134405  normal  0.334505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.44 
 
 
285 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.02 
 
 
317 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  40.78 
 
 
233 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.57 
 
 
259 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>