236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1498 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1498  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  587  1e-166  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  1.76809e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.73 
 
 
278 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  35.82 
 
 
296 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  28.85 
 
 
297 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  27.42 
 
 
310 aa  84  2e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  32.7 
 
 
296 aa  84.3  2e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  32.7 
 
 
296 aa  81.6  1e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  37.41 
 
 
297 aa  80.9  3e-14  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  28.44 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.96 
 
 
294 aa  78.6  1e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  30.29 
 
 
350 aa  78.2  1e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  28.44 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  30.29 
 
 
306 aa  78.2  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  28.44 
 
 
306 aa  78.6  1e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 
368 aa  78.2  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  77.8  2e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  28.44 
 
 
306 aa  77.8  2e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  27.34 
 
 
273 aa  78.2  2e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  35.11 
 
 
306 aa  77.4  3e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  26.64 
 
 
303 aa  76.3  6e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 
306 aa  75.9  8e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 
298 aa  75.5  1e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  34.64 
 
 
308 aa  74.7  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  26.74 
 
 
298 aa  73.9  3e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  34.35 
 
 
308 aa  73.2  4e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  33.13 
 
 
301 aa  73.2  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  26.36 
 
 
298 aa  73.2  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  33.6 
 
 
305 aa  72.8  6e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  36.22 
 
 
303 aa  72.8  6e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  25.64 
 
 
310 aa  72.8  7e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.17 
 
 
924 aa  72.8  7e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  26.74 
 
 
298 aa  72  9e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  26.72 
 
 
298 aa  72  1e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  33.99 
 
 
318 aa  71.2  2e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
309 aa  70.5  3e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  26.27 
 
 
298 aa  70.5  3e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  33.58 
 
 
297 aa  70.9  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  24.6 
 
 
271 aa  70.5  3e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.59 
 
 
305 aa  70.9  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  31.36 
 
 
309 aa  70.5  3e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  30.59 
 
 
309 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  30.59 
 
 
309 aa  70.1  4e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  34.07 
 
 
237 aa  70.1  4e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  27.57 
 
 
301 aa  69.7  5e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 
270 aa  69.7  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 
309 aa  69.7  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  30.77 
 
 
309 aa  69.3  6e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  29.81 
 
 
309 aa  69.3  6e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  34.67 
 
 
309 aa  69.3  7e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  31.33 
 
 
309 aa  68.9  9e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  27.31 
 
 
301 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.54 
 
 
301 aa  67.4  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  32.34 
 
 
300 aa  67  4e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  29.22 
 
 
295 aa  65.9  7e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6358  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 
316 aa  65.5  9e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  31.51 
 
 
308 aa  64.3  2e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.39 
 
 
305 aa  64.7  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  31.51 
 
 
290 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5480  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.03 
 
 
272 aa  64.3  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  0.229793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  24.42 
 
 
371 aa  63.5  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26 
 
 
317 aa  63.2  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.181708  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  27.16 
 
 
297 aa  63.5  4e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  32.48 
 
 
312 aa  63.5  4e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  34.4 
 
 
298 aa  63.5  4e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  34.4 
 
 
298 aa  63.2  4e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  31.51 
 
 
300 aa  63.2  5e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.07 
 
 
289 aa  62.8  6e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 
301 aa  62.8  7e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  31.51 
 
 
300 aa  62.8  7e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.5 
 
 
340 aa  62.4  8e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3560  xylose isomerase domain-containing protein  31.97 
 
 
300 aa  62  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  27.43 
 
 
297 aa  61.2  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.39 
 
 
300 aa  60.8  2e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3059  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 
356 aa  61.2  2e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  33.86 
 
 
294 aa  61.2  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  30.98 
 
 
302 aa  60.8  3e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.19 
 
 
359 aa  59.7  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  32.19 
 
 
359 aa  59.7  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.65 
 
 
298 aa  59.3  6e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  33.1 
 
 
300 aa  59.3  7e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.17 
 
 
284 aa  59.3  8e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4720  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.91 
 
 
284 aa  58.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  29.34 
 
 
308 aa  58.5  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4691  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.17 
 
 
284 aa  58.9  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  30.43 
 
 
302 aa  58.9  1e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  27.66 
 
 
258 aa  58.5  1e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1275  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.11 
 
 
356 aa  58.2  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4393  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.41 
 
 
271 aa  57.8  2e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.52242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1232  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.81 
 
 
279 aa  57  3e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  hitchhiker  0.00338141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4048  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.78 
 
 
286 aa  57.4  3e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  29.13 
 
 
298 aa  57  4e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1807  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.88 
 
 
277 aa  57  4e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1264  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.36 
 
 
274 aa  57  4e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  28.06 
 
 
287 aa  57  4e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1061  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 
341 aa  55.8  8e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5217  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.63 
 
 
272 aa  55.5  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.592377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  24.52 
 
 
304 aa  55.1  1e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00431  Xylose isomerase-like TIM barrel  29.06 
 
 
355 aa  55.1  1e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.917632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>