62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1488 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  100 
 
 
104 aa  205  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1887  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9201  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1954  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0543134  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3509  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1101  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00196595  hitchhiker  0.000145009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3885  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11439  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8713  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0202623  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1455  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566564  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3194  transcriptional regulator, ArsR family  37.78 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.847871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1986  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1330  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0641  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1561  regulatory protein ArsR  32.29 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.442352  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0433  regulatory protein, ArsR  32.63 
 
 
100 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0836  regulatory protein, ArsR  31.46 
 
 
101 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
200 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  36.92 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1222  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  33.87 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  34.09 
 
 
211 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 
282 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11220  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
358 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  29.23 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  38.6 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 
212 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 
227 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  30.14 
 
 
187 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0909  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
228 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000018626  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
116 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  31.15 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
117 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  31.75 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  32.91 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  34.67 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  32.79 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  39.66 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  25.77 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  25.77 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
95 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>