100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1233 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  587  1e-166  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  61.62 
 
 
284 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  61.25 
 
 
284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  58.52 
 
 
280 aa  323  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  58.8 
 
 
278 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  56.68 
 
 
275 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  57.76 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  56.63 
 
 
282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  53.28 
 
 
268 aa  308  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  58.12 
 
 
279 aa  308  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  56.55 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  55.96 
 
 
280 aa  301  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  56.86 
 
 
276 aa  295  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  53.99 
 
 
297 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  53.14 
 
 
281 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  53.7 
 
 
269 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  52.99 
 
 
278 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  53.33 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  55.43 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  50.56 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  53.85 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  50.19 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  54.18 
 
 
283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  50.19 
 
 
274 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  52.94 
 
 
276 aa  276  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  50.75 
 
 
277 aa  276  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  51.47 
 
 
276 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  53.28 
 
 
272 aa  275  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  55.21 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  53.91 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  53.73 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  51.32 
 
 
279 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  43.24 
 
 
272 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  36.19 
 
 
350 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  30.2 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  30.48 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  29.79 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  24.8 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  27.23 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  28.09 
 
 
354 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  27.68 
 
 
349 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  25.85 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  27.31 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  43.06 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  25.93 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  24.29 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  24.16 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  33.06 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  34.18 
 
 
620 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  38.98 
 
 
689 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  28.21 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 
640 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
683 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  28.95 
 
 
828 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  38.18 
 
 
669 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  38.18 
 
 
668 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 
361 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  26.51 
 
 
312 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  38.18 
 
 
640 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
684 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.68 
 
 
684 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  38.18 
 
 
671 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  33.66 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  35.44 
 
 
325 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  37.14 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.08 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  38.37 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  29.84 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  28.97 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  29.03 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.73 
 
 
629 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  26.21 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  26.55 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  24.15 
 
 
608 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0059  peptidase S49, SppA  31.53 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0430254  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.85 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  31.58 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  39.78 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  31.58 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  32.89 
 
 
247 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  34.57 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  43.64 
 
 
70 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  29.46 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.85 
 
 
321 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  34.02 
 
 
348 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  30.53 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  28.46 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.7 
 
 
324 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>