More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1204 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  100 
 
 
519 aa  1058  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  46.77 
 
 
671 aa  444  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  43 
 
 
510 aa  392  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
654 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
572 aa  338  1e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
609 aa  338  2e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  37.25 
 
 
797 aa  337  3e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  37.27 
 
 
558 aa  333  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
791 aa  331  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
577 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
549 aa  323  6e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  37.07 
 
 
749 aa  321  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  38.87 
 
 
549 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
682 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  36.44 
 
 
556 aa  312  9e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
547 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  37.47 
 
 
545 aa  310  5e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  37.65 
 
 
542 aa  309  9e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  35.74 
 
 
551 aa  307  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
628 aa  305  1e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.86 
 
 
583 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  35.77 
 
 
640 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
591 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  35.48 
 
 
770 aa  286  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  35.42 
 
 
489 aa  283  5e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
991 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
1319 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
722 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
847 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  37.16 
 
 
1255 aa  280  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
492 aa  276  6e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
831 aa  276  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
492 aa  276  9e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  30.2 
 
 
1335 aa  273  4e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  39.48 
 
 
547 aa  273  7e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
491 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
692 aa  271  3e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
610 aa  263  5e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  37.77 
 
 
512 aa  259  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  36.13 
 
 
617 aa  254  4e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  34.52 
 
 
604 aa  253  4e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  35.59 
 
 
618 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
549 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  36.98 
 
 
513 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
620 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
546 aa  245  2e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  37.06 
 
 
622 aa  243  5e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  33.27 
 
 
543 aa  243  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  36.16 
 
 
546 aa  243  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
546 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  36.5 
 
 
546 aa  240  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  44.84 
 
 
612 aa  238  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.91 
 
 
557 aa  226  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
557 aa  222  1e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
473 aa  221  2e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
557 aa  214  2e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
559 aa  214  2e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  32.65 
 
 
476 aa  214  3e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  32.16 
 
 
557 aa  214  3e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  33.83 
 
 
483 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  29.76 
 
 
552 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  28.91 
 
 
548 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
553 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
553 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
553 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  29.46 
 
 
553 aa  207  4e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  29.98 
 
 
552 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.26 
 
 
311 aa  204  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  29.26 
 
 
544 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  30.85 
 
 
515 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  32.11 
 
 
428 aa  176  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  32.11 
 
 
428 aa  176  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  32.11 
 
 
428 aa  176  1e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.62566e-05  hitchhiker  7.63288e-08 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  34.65 
 
 
463 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  32.68 
 
 
500 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.2 
 
 
458 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
463 aa  167  3e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
485 aa  166  6e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  32.48 
 
 
504 aa  167  6e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  32.69 
 
 
480 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  31.22 
 
 
467 aa  166  1e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  34.72 
 
 
476 aa  165  2e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  33.72 
 
 
432 aa  165  2e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  33.99 
 
 
491 aa  165  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  33.15 
 
 
488 aa  165  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  32.75 
 
 
466 aa  165  2e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
485 aa  164  4e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  34.03 
 
 
508 aa  164  4e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
483 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
482 aa  163  8e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
482 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  33.12 
 
 
482 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.71 
 
 
491 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0031  type II secretion system protein E  30.68 
 
 
494 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  31.87 
 
 
482 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  32.84 
 
 
484 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  32.5 
 
 
482 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  34.67 
 
 
492 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
478 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  33.14 
 
 
433 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>