204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1117 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  42.54 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  45.56 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  43.72 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  39.66 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  42.78 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  37.71 
 
 		 180 aa  134  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  42.93 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  43.82 
 
 		 187 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  40.88 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  38.38 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  40.11 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  37.16 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  38.64 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  34.83 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.76 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  38.2 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  36.46 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  38.2 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  34.66 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  32.78 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.48 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.63 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.57 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  34.76 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  34.46 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  34.86 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.24 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  28.19 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.77 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.91 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  34.1 
 
 		 189 aa  84.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  34.03 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.91 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.07 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  34.03 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.76 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  36.87 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 183 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.05 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.05 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.05 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  36.5 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  29.57 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.06 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  37.37 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  30.95 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.03 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.08 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  28.03 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  29.94 
 
 		 271 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  32.56 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  32.02 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  32.86 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>