295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1081 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 804 aa  1546    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  30.86 
 
 		 702 aa  261  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  31.07 
 
 		 702 aa  252  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  31.74 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.85 
 
 		 858 aa  154  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.17 
 
 		 864 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  47.48 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.22 
 
 		 895 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.98 
 
 		 926 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  25.48 
 
 		 802 aa  126  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  21.95 
 
 		 891 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 693 aa  101  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.56 
 
 		 805 aa  94.7  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  23.46 
 
 		 993 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.14 
 
 		 902 aa  89.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  24.76 
 
 		 795 aa  87  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.16 
 
 		 1019 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.75 
 
 		 1021 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.88 
 
 		 924 aa  84.3  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.01 
 
 		 993 aa  84.3  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  23.38 
 
 		 994 aa  81.6  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.44 
 
 		 813 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.38 
 
 		 1061 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.46 
 
 		 890 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.24 
 
 		 993 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  40.59 
 
 		 1019 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 		 1057 aa  75.5  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  25.16 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  23.96 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25.75 
 
 		 1074 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.3 
 
 		 935 aa  72  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.6 
 
 		 891 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  21.93 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  25.94 
 
 		 784 aa  70.1  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.05 
 
 		 789 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.33 
 
 		 859 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  28.93 
 
 		 912 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  26.88 
 
 		 980 aa  67.4  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  27.16 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.43 
 
 		 1038 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  21.3 
 
 		 1018 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  30.66 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  25.44 
 
 		 1018 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  25.43 
 
 		 1016 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  24.23 
 
 		 790 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  25.37 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  23.3 
 
 		 1008 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  21.18 
 
 		 888 aa  60.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  20.44 
 
 		 1189 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  24.21 
 
 		 1074 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 1018 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  22.49 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0981  hypothetical protein  26.85 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000423266  decreased coverage  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  25.28 
 
 		 1018 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  27.9 
 
 		 1081 aa  57.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  25.28 
 
 		 1018 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  32.53 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.92 
 
 		 961 aa  57  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.66 
 
 		 1031 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  21.64 
 
 		 857 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  26.24 
 
 		 1018 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.51 
 
 		 978 aa  56.6  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  23.23 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 		 1196 aa  56.6  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 1018 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.39 
 
 		 859 aa  55.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  23.93 
 
 		 1187 aa  55.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 		 1182 aa  55.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.54 
 
 		 1186 aa  55.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 1041 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  31.82 
 
 		 987 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  26.56 
 
 		 1099 aa  54.7  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  27.35 
 
 		 662 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.7 
 
 		 1013 aa  54.7  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  36.96 
 
 		 224 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  24.8 
 
 		 1185 aa  54.3  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  23.64 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  23.64 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  28.32 
 
 		 995 aa  54.3  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  35.96 
 
 		 544 aa  54.3  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  35.96 
 
 		 544 aa  54.3  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  23.86 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 238 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 544 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 544 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  31.82 
 
 		 987 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  24.71 
 
 		 1170 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.43 
 
 		 810 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  35.96 
 
 		 544 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  26.56 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23.47 
 
 		 1179 aa  52.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  22.97 
 
 		 1148 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  24.4 
 
 		 1162 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  35.96 
 
 		 544 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  23.13 
 
 		 661 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  22.72 
 
 		 1093 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>