120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1049 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
316 aa  636    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  38.46 
 
 
302 aa  199  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  38.75 
 
 
306 aa  199  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  38.1 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  37.01 
 
 
301 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  37.41 
 
 
306 aa  190  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  34.05 
 
 
285 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
301 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
302 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
295 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  33.77 
 
 
304 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  35.74 
 
 
286 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  36.06 
 
 
302 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  31.67 
 
 
301 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  32.33 
 
 
303 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  32.99 
 
 
294 aa  149  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  34.15 
 
 
299 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  32.52 
 
 
298 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  34.22 
 
 
320 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 
526 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  32.52 
 
 
298 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  32.17 
 
 
298 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  31.23 
 
 
285 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  31.82 
 
 
292 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  33.94 
 
 
288 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  29.12 
 
 
422 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  30.56 
 
 
405 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  29.64 
 
 
286 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  30.69 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  31.25 
 
 
287 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  27.47 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  28.44 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  28.33 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  25.4 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  27.03 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  27.65 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  26.79 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  26.27 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  27.83 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  26.32 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  26.56 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  26.2 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  29.8 
 
 
254 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  26.82 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
280 aa  59.3  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 
266 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
261 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  27.67 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  26.85 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  28.5 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  28.1 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  27.49 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  32.56 
 
 
296 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  29.84 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  26.64 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  26.42 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  27.44 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  27.62 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  23.23 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  28.16 
 
 
240 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  26.63 
 
 
495 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  25.35 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  31.73 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  26.64 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  25.94 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  25.94 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  25.94 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  25.94 
 
 
286 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  26.64 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2868  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  29.73 
 
 
520 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  26.89 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  24.88 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  29.44 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  27.57 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  25.47 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  27.65 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  24.76 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
190 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  28.57 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  25.47 
 
 
285 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  25.94 
 
 
286 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  25.51 
 
 
286 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  25.35 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  25.98 
 
 
278 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  26.15 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  27.31 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  25.12 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  25.35 
 
 
284 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  26.03 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  24.71 
 
 
626 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>