More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1014 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  100 
 
 
417 aa  808    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  46.53 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  44.15 
 
 
411 aa  344  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  40.24 
 
 
422 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  37.81 
 
 
413 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  37.56 
 
 
413 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  38.64 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  37.53 
 
 
414 aa  229  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  35.96 
 
 
436 aa  229  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  36.19 
 
 
414 aa  226  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  35.28 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  36.68 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  38 
 
 
404 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  37.59 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  38.31 
 
 
421 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  38.12 
 
 
433 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  38.35 
 
 
420 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  34.98 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  36.39 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  34.03 
 
 
400 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  30.97 
 
 
419 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  30.26 
 
 
405 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  29.72 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.13 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  31.17 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.68 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  31.14 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  31.43 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.65 
 
 
429 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  32.66 
 
 
404 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.97 
 
 
396 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.75 
 
 
431 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  28.35 
 
 
441 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.94 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.71 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  27.97 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  31.84 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  27.8 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.39 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.21 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.07 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  28.12 
 
 
444 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  28.12 
 
 
444 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  28.12 
 
 
444 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  28.12 
 
 
444 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.87 
 
 
421 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  28.21 
 
 
417 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  28.12 
 
 
441 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  27.27 
 
 
441 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  27.27 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  28.03 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  29.69 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  27.23 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  27.98 
 
 
437 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  31.32 
 
 
396 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  27.67 
 
 
424 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  27.8 
 
 
437 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  27.8 
 
 
437 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  30.24 
 
 
414 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.69 
 
 
440 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.07 
 
 
424 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.46 
 
 
426 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.04 
 
 
427 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  28.5 
 
 
408 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  29.5 
 
 
422 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.76 
 
 
427 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.78 
 
 
423 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.92 
 
 
441 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  26.8 
 
 
440 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.92 
 
 
441 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.8 
 
 
429 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.94 
 
 
426 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  28.22 
 
 
451 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  27.52 
 
 
441 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.27 
 
 
465 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.19 
 
 
451 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.22 
 
 
577 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  27.18 
 
 
440 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  29.82 
 
 
429 aa  99.8  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.02 
 
 
427 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.38 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  30.72 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  30.72 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.27 
 
 
441 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  30.72 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  30.72 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  26.41 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  27.96 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  27.27 
 
 
428 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  28.57 
 
 
431 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.2 
 
 
431 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  28.31 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  27.34 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  28.49 
 
 
378 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  25.37 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  30.03 
 
 
385 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  30.13 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  25.37 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  30.03 
 
 
385 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>