43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0852 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  30.71 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  31.58 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  29.17 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.52 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  26.03 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.08 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  23.91 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  23.75 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  26.03 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  27.32 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  27.32 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  22.65 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  23.29 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  27.92 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  24.17 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.02 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  28.21 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  23.16 
 
 		 331 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  23.7 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  23.08 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  26.14 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  25.64 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  25.49 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.74 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  29.01 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  29.01 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  29.01 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  23.43 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  29.01 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  24.51 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  29.01 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.83 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  24.88 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.74 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.83 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  28.89 
 
 		 342 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.14 
 
 		 225 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>