29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0824 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  295  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1126  hypothetical protein  45.19 
 
 
133 aa  110  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000923187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0078  hypothetical protein  42.52 
 
 
134 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0087  hypothetical protein  47.24 
 
 
133 aa  104  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0052  hypothetical protein  45.22 
 
 
113 aa  100  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  30.66 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  29.58 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  29.93 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  32.35 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30.25 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  31.37 
 
 
237 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  31.76 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  40.32 
 
 
244 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.15 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  31.03 
 
 
250 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0525  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  29.17 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  27.78 
 
 
224 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  24.62 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  26.72 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 
444 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  34.29 
 
 
268 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  24.79 
 
 
230 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  48.57 
 
 
250 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  37.93 
 
 
244 aa  40  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>