More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0672 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  100 
 
 
493 aa  971    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  33.18 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.83 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34.96 
 
 
447 aa  213  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  34.19 
 
 
468 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  31.77 
 
 
474 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.78 
 
 
464 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.72 
 
 
492 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.35 
 
 
480 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  30.8 
 
 
466 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  33.33 
 
 
493 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.77 
 
 
463 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.77 
 
 
463 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32.23 
 
 
441 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  31.24 
 
 
480 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  33.86 
 
 
475 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.42 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  34.13 
 
 
486 aa  190  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.12 
 
 
477 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  31.34 
 
 
484 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  30.19 
 
 
467 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  31.72 
 
 
504 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  30.23 
 
 
474 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.02 
 
 
457 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  35.03 
 
 
487 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.97 
 
 
459 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.45 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  32.24 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  32.24 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  32.56 
 
 
468 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  31.21 
 
 
491 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  29.45 
 
 
485 aa  183  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.65 
 
 
458 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  30.34 
 
 
491 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.52 
 
 
446 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.74 
 
 
450 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  31.73 
 
 
499 aa  182  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  33.12 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  31.18 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  30.89 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.82 
 
 
491 aa  181  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  30.54 
 
 
482 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  30.48 
 
 
444 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.84 
 
 
533 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  31.32 
 
 
480 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.74 
 
 
480 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  31.97 
 
 
544 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  32.03 
 
 
468 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  32.11 
 
 
475 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  30.33 
 
 
480 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  32.63 
 
 
485 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  29.79 
 
 
471 aa  177  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.69 
 
 
480 aa  176  9e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  30.85 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  31.2 
 
 
472 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  30.33 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  30.92 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  30.8 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  30.63 
 
 
437 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  28.81 
 
 
475 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  30.06 
 
 
482 aa  173  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  28.35 
 
 
457 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  28.82 
 
 
468 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.6 
 
 
472 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  31.45 
 
 
465 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  30.2 
 
 
466 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.46 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  32.29 
 
 
516 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  33.26 
 
 
443 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.46 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.46 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.46 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  27.99 
 
 
473 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31 
 
 
497 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.46 
 
 
464 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.3 
 
 
476 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.37 
 
 
464 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  30.99 
 
 
443 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  30.98 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  33.33 
 
 
494 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  30.02 
 
 
470 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  28.42 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  27.66 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  31.33 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  27.66 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  27.66 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  27.66 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  27.66 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>