More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0652 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
486 aa  998  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  7.39457e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  56.26 
 
 
489 aa  551  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  44.01 
 
 
467 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.40299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
517 aa  389  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 
513 aa  354  2e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 
885 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  31.52 
 
 
934 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  31.48 
 
 
418 aa  213  4e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  31.62 
 
 
417 aa  200  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  28.34 
 
 
432 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  28.06 
 
 
446 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  29.72 
 
 
450 aa  184  2e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.72 
 
 
439 aa  185  2e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  27.87 
 
 
442 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  29.25 
 
 
451 aa  180  5e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 
431 aa  180  6e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.37 
 
 
444 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  29.4 
 
 
438 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  28.57 
 
 
452 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 
431 aa  176  1e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  27.81 
 
 
446 aa  176  1e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
443 aa  175  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  27.61 
 
 
446 aa  175  2e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.74 
 
 
446 aa  174  3e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  27.82 
 
 
449 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.86 
 
 
457 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30.89 
 
 
439 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.17 
 
 
471 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  28.63 
 
 
447 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.86 
 
 
457 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  29.39 
 
 
476 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  28.08 
 
 
451 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  28.38 
 
 
453 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  27.77 
 
 
451 aa  164  4e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  27.77 
 
 
451 aa  164  4e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31.13 
 
 
472 aa  163  8e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  28.51 
 
 
452 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  27.98 
 
 
478 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 
427 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  29.26 
 
 
479 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  27.77 
 
 
451 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  29.53 
 
 
482 aa  160  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  28.25 
 
 
443 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  29.74 
 
 
448 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  27.66 
 
 
448 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
413 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.73 
 
 
491 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  26.82 
 
 
478 aa  154  3e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  26.76 
 
 
472 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  27.76 
 
 
443 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  28.13 
 
 
443 aa  153  6e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  26.13 
 
 
470 aa  152  9e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  29.1 
 
 
485 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  28.4 
 
 
436 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  27.35 
 
 
446 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  28.23 
 
 
444 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  27.73 
 
 
461 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  29.73 
 
 
482 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  29.29 
 
 
447 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.93 
 
 
452 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  28.8 
 
 
474 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  29.05 
 
 
445 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.45 
 
 
443 aa  149  1e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  26.29 
 
 
461 aa  148  2e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.85051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
478 aa  148  2e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 
447 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  28.86 
 
 
488 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  25.67 
 
 
468 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  27.55 
 
 
484 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.15907e-05  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  25.79 
 
 
470 aa  147  4e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  28.17 
 
 
455 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.48 
 
 
465 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28.36 
 
 
458 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  26.08 
 
 
467 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  26.6 
 
 
444 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  28.8 
 
 
470 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  27.61 
 
 
440 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  25.05 
 
 
475 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  27.63 
 
 
435 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  26.99 
 
 
433 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.76 
 
 
458 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  25.34 
 
 
457 aa  145  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 
427 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  28.57 
 
 
448 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  27.27 
 
 
460 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  27.69 
 
 
453 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  27.02 
 
 
460 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  26.47 
 
 
487 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  27.07 
 
 
460 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  27.02 
 
 
460 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  27.78 
 
 
457 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  27.34 
 
 
452 aa  143  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  27.07 
 
 
460 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  28.76 
 
 
437 aa  142  1e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  25.96 
 
 
462 aa  142  1e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  26.53 
 
 
450 aa  142  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  28.93 
 
 
494 aa  142  2e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  28.66 
 
 
458 aa  142  2e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  25.44 
 
 
459 aa  141  2e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  26.6 
 
 
465 aa  142  2e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>