24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0575 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
277 aa  555  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  57.78 
 
 
302 aa  321  8e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  58.52 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  40.15 
 
 
302 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  37.12 
 
 
299 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  36.88 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  29.06 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  24.05 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  24.05 
 
 
330 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  22.3 
 
 
335 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  28.21 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  25.32 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  27.89 
 
 
334 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  24.75 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  26.39 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  23.66 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  22.48 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  23.47 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.26 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  32.22 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  22.14 
 
 
342 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  23.65 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  26.21 
 
 
699 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  23.89 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>