More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0523 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 402 aa  812    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  37.84 
 
 		 430 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  38.31 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  37.84 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  36.78 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  37.75 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  36.1 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  37.44 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  34.33 
 
 		 409 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.84 
 
 		 413 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  36.79 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  37.47 
 
 		 420 aa  232  8.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.99 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  37.31 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.64 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  37.38 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  37.31 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 416 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  33.58 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  35.82 
 
 		 424 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  35.5 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  36.2 
 
 		 399 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 		 434 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  37.22 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  36.04 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  34.13 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  36.26 
 
 		 859 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  35.66 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 416 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  33.84 
 
 		 419 aa  219  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  36.05 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  36.34 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.09 
 
 		 859 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  36.94 
 
 		 878 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  35.54 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  35.53 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  34.89 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  35.18 
 
 		 425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  34.14 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  34.24 
 
 		 423 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  34.16 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  35.44 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  34.47 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  36.34 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  36.06 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  32.93 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  35.01 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  36.57 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  35.32 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  35.44 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  35.58 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  36.23 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  35.07 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  35.82 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  34.42 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  35.98 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  36.48 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  32.03 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  33.58 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  35.66 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  34.5 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  35.32 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  33.82 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  36.78 
 
 		 868 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  36.81 
 
 		 868 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  36.91 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  33.89 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  33.9 
 
 		 416 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  33.88 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  35.07 
 
 		 416 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  34.24 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  32.84 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  34.07 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  35.98 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  35.07 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  35.07 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  32.94 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  34.05 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  32.73 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.05 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  35.12 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  33.73 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  33.58 
 
 		 419 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>