More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0504 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  100 
 
 		 379 aa  733    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2110  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0505965  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  28.53 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.77 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 436 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 436 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 431 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 441 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  28.61 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 422 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  26.8 
 
 		 447 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 447 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  28.61 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 439 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  25.28 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 438 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 441 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 450 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.84 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.03 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.42 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.91 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.55 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.55 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.84 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.55 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.92 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>