More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0478 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
98 aa  207  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000449419  decreased coverage  0.000160818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.58 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2370  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.5 
 
 
96 aa  128  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.5 
 
 
96 aa  127  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.512756  hitchhiker  0.00122416 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.89 
 
 
96 aa  120  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1433  putative ferredoxin like protein; FixX  48.48 
 
 
99 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102242  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10550  FixX ferredoxin-like protein  51.65 
 
 
94 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0834352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0061  ferredoxin  44.57 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2316  putative ferredoxin like protein; FixX  45.45 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00117269  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.56 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1477  ferredoxin-like protein  45.74 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1193  putative ferredoxin like protein; FixX  45.74 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.170567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1371  putative ferredoxin like protein; FixX  42.55 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7736  putative ferredoxin like protein; FixX  44.44 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1938  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.26 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.62 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3926  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.79 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.540804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3555  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.05 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.35 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1259  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.35 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
92 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200948  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.62 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2264  ferredoxin  43 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0290114  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  37.11 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00147528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  42.55 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.84 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6231  FixX ferredoxin-like protein  41.76 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3574  ferredoxin-like protein  48.35 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.183526  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0490  putative ferredoxin protein, FixX  43.01 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4012  ferredoxin-like protein  45.05 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.82 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0589  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.23 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000249296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1552  ferredoxin-like protein  43.96 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281745  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.96 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.362888  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0139  putative ferredoxin protein, FixX  39 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5869  putative ferredoxin protein, FixX  41 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2123  hypothetical protein  37.36 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0987  ferredoxin like protein, fixX  41.94 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0910173 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0921  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.801629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02612  predicted 4Fe-4S cluster-containing protein  39.76 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0945  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02575  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2907  putative ferredoxin  39.76 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3069  putative ferredoxin  39.76 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3106  putative ferredoxin  39.76 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0911919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1844  putative ferredoxin  36.96 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.148081  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3613  putative ferredoxin protein, FixX  41.76 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3233  putative ferredoxin  36.96 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.02 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0087  ferredoxin-like protein ydiT  40.43 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0085  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.807465  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.951067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0084  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.588767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2896  putative ferredoxin  38.55 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4042  putative ferredoxin  36.96 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4926  FixX ferredoxin-like protein  40.43 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2680  putative ferredoxin  36.56 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4022  putative ferredoxin  37.35 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.878654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4445  ferredoxin like protein, fixX  37.63 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1091  ferredoxin like protein, fixX  38.71 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1398  ferredoxin-like protein  36 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0672004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00048  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3555  putative ferredoxin  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0048  ferredoxin homolog FixX  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0050  ferredoxin homolog FixX  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3611  putative ferredoxin  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0046  ferredoxin homolog FixX  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00047  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1435  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0048  ferredoxin homolog FixX  37.63 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5083  putative ferredoxin protein, FixX  37.63 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0575  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2197  iron-sulfur cluster-binding protein FixX  36.08 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1463  ferredoxin like protein  37.62 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1993  ferredoxin like protein  37.62 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.0253227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.36 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1821  putative ferredoxin  37.62 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1481  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain-containing protein  37.62 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0731484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1447  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  37.62 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.128489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09260  ferredoxin-like protein  37 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.759582 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3107  putative ferredoxin  36.56 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27810  ferredoxin-like protein  35.29 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1821  putative ferredoxin  36.56 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.09414  normal  0.305366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1028  putative ferredoxin  27.96 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0314  putative ferredoxin  30.85 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.42 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1917  iron-sulfur cluster-binding protein  34.02 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2417  iron-sulfur cluster-binding protein  34.02 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1903  iron-sulfur cluster-binding protein  34.02 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1495  iron-sulfur cluster-binding protein  34.02 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.306818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01669  predicted 4Fe-4S ferredoxin-type protein  34.02 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01658  hypothetical protein  34.02 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1942  iron-sulfur cluster-binding protein  34.02 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08760  ferredoxin-like protein  34.31 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.696801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1931  hypothetical protein  34.02 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0527008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03178  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  35.63 
 
 
549 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0574  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.25 
 
 
548 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0623  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.25 
 
 
548 aa  55.1  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>