38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0453 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0453  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  211  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.701032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1699  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1684  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1970  regulatory protein, ArsR  35.05 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0202  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1369  regulatory protein ArsR  36 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3387  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1531  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0951633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1509  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0832432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1313  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2818  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2804  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.30723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2381  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43402  normal  0.916761 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2904  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  34.92 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  28.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0307  regulatory protein, ArsR  39.66 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 91 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  35.38 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0946  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  31.82 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  28.92 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 337 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  27.54 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 110 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  27.38 
 
 		 99 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 110 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 317 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>