More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0440 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0440  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
262 aa  510  1e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  50.19 
 
 
278 aa  251  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2213  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.04 
 
 
256 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0185334  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  48.63 
 
 
256 aa  237  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.1 
 
 
257 aa  227  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.84 
 
 
242 aa  125  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.95 
 
 
259 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.07 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  37.5 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.95 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.46 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.95 
 
 
259 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.38 
 
 
263 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.93 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.31 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.85 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.6 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.85 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.85 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.46 
 
 
240 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2465  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.58 
 
 
263 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000280945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.47 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  36.46 
 
 
266 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.12 
 
 
260 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.17 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.08 
 
 
257 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.63 
 
 
266 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.11 
 
 
266 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.59 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.64 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.96 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.03 
 
 
262 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.2 
 
 
259 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.47 
 
 
610 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  31.39 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.3 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.1 
 
 
259 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.74 
 
 
258 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.21 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10410  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.61 
 
 
268 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.86 
 
 
286 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.93 
 
 
265 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.13 
 
 
258 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.68 
 
 
263 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.32 
 
 
259 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.89 
 
 
251 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
257 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2742  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.53 
 
 
270 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  34.51 
 
 
251 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.28 
 
 
249 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.28 
 
 
249 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  31.4 
 
 
252 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.45 
 
 
261 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.08 
 
 
263 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.84 
 
 
261 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.05 
 
 
258 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.8 
 
 
262 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.62 
 
 
252 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.7 
 
 
258 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.68 
 
 
259 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.07 
 
 
249 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.44 
 
 
258 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.71 
 
 
264 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.37 
 
 
249 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.01 
 
 
252 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.5 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.85 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.7 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.37 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  32.85 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.58 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.58 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.43 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.7 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.26 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1725  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.33 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.363421  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.26 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.9 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.9 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.1 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.37 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.18 
 
 
268 aa  98.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  31.9 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.9 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.9 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.51 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.94 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  30.26 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.9 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.83 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.05 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.88 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.86 
 
 
601 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.01 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>