More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0424 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  100 
 
 
489 aa  983  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  38.92 
 
 
491 aa  357  4e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  38.22 
 
 
492 aa  345  9e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  38.51 
 
 
492 aa  343  4e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
510 aa  333  4e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.22 
 
 
671 aa  302  8e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  35 
 
 
545 aa  287  4e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.42 
 
 
519 aa  283  4e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  42.26 
 
 
311 aa  272  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  32.54 
 
 
556 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  32.98 
 
 
797 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  31 
 
 
547 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  33.48 
 
 
654 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.79 
 
 
577 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
991 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  32.4 
 
 
609 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
628 aa  260  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  34.23 
 
 
572 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
640 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  31.18 
 
 
558 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
549 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
551 aa  255  1e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  33.41 
 
 
692 aa  254  2e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  32.21 
 
 
583 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
557 aa  250  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
542 aa  249  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  31.21 
 
 
791 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  31.29 
 
 
682 aa  244  2e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
749 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  29.47 
 
 
549 aa  243  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  30.97 
 
 
591 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.63 
 
 
549 aa  237  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
546 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  33.26 
 
 
546 aa  230  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
512 aa  230  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  30.87 
 
 
722 aa  230  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
546 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  31.39 
 
 
546 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.97 
 
 
543 aa  228  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  31.33 
 
 
559 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.42 
 
 
547 aa  226  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  30.97 
 
 
770 aa  224  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
557 aa  222  1e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  34.1 
 
 
513 aa  219  9e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  30.69 
 
 
557 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  29.64 
 
 
1319 aa  215  2e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  31.88 
 
 
604 aa  215  2e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  29.49 
 
 
847 aa  212  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  30.02 
 
 
557 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  30.03 
 
 
1255 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
831 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  29.38 
 
 
1335 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
610 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
473 aa  198  2e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.63 
 
 
515 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
553 aa  193  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
553 aa  193  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
553 aa  193  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
553 aa  193  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.08 
 
 
552 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.1 
 
 
552 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
548 aa  191  3e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  31.49 
 
 
617 aa  191  3e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  31.22 
 
 
544 aa  186  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
463 aa  184  2e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  34.4 
 
 
612 aa  185  2e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
463 aa  183  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
476 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  29.56 
 
 
618 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  31.54 
 
 
465 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  29.34 
 
 
622 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.81 
 
 
444 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
463 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
472 aa  176  1e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.73 
 
 
572 aa  174  3e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.8 
 
 
473 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.21 
 
 
477 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.54 
 
 
452 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
417 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  34.26 
 
 
677 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  28.79 
 
 
620 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.83 
 
 
474 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
472 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.52 
 
 
569 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  34.55 
 
 
472 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.66 
 
 
428 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.62566e-05  hitchhiker  7.63288e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
428 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.83 
 
 
412 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
423 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.66 
 
 
428 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.63 
 
 
478 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.58 
 
 
594 aa  167  3e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
440 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  31.71 
 
 
521 aa  167  6e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.5 
 
 
624 aa  165  1e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.01 
 
 
515 aa  166  1e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.32 
 
 
474 aa  165  2e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  32.93 
 
 
487 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.31 
 
 
442 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  35.01 
 
 
523 aa  164  4e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>