More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0408 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
489 aa  1011  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  56.26 
 
 
486 aa  551  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  7.39457e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  44.38 
 
 
467 aa  417  1e-115  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.40299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 
517 aa  410  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  43.31 
 
 
513 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 
934 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  32.62 
 
 
885 aa  245  1e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  31.6 
 
 
418 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  29.65 
 
 
432 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  31.59 
 
 
417 aa  195  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
431 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
431 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  9.05056e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
442 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  29.55 
 
 
436 aa  180  6e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
443 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  27.52 
 
 
446 aa  175  2e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  28 
 
 
446 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  28.77 
 
 
450 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  27.8 
 
 
446 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  28.77 
 
 
446 aa  171  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  26.26 
 
 
449 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  26.72 
 
 
439 aa  163  5e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  26.54 
 
 
475 aa  163  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  27.76 
 
 
452 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  28.54 
 
 
451 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  26.43 
 
 
451 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  27.31 
 
 
465 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.33 
 
 
451 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 
427 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.52 
 
 
451 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  26.52 
 
 
451 aa  157  5e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.19 
 
 
427 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  27.09 
 
 
448 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  26.72 
 
 
478 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  28.19 
 
 
443 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  27.4 
 
 
457 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  28.95 
 
 
463 aa  153  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  28.2 
 
 
457 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  25.15 
 
 
444 aa  153  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  27.38 
 
 
438 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
478 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  28.06 
 
 
443 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  27.25 
 
 
453 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  26.41 
 
 
452 aa  149  1e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  26.34 
 
 
446 aa  149  1e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  26.89 
 
 
468 aa  148  2e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  28.96 
 
 
433 aa  147  4e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  27.17 
 
 
476 aa  147  4e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  25 
 
 
470 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  27.94 
 
 
465 aa  146  8e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  25.64 
 
 
447 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.06 
 
 
471 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  26.89 
 
 
453 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  28.34 
 
 
439 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  27.59 
 
 
440 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  26.79 
 
 
443 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  26.49 
 
 
470 aa  143  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  26.67 
 
 
443 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  26.43 
 
 
459 aa  143  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  27.33 
 
 
435 aa  142  1e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  26.3 
 
 
470 aa  142  1e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  28.02 
 
 
472 aa  142  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  26.3 
 
 
470 aa  142  1e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  27.11 
 
 
448 aa  142  2e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  27.42 
 
 
482 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  27.59 
 
 
455 aa  140  4e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  24.95 
 
 
452 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  26.67 
 
 
444 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  25.1 
 
 
444 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  25.42 
 
 
491 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.76 
 
 
440 aa  137  6e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  25.15 
 
 
456 aa  136  7e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  26.15 
 
 
468 aa  136  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  24.71 
 
 
472 aa  135  1e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
413 aa  135  1e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
447 aa  135  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  26.1 
 
 
459 aa  135  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  26.07 
 
 
467 aa  135  2e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  26.29 
 
 
445 aa  135  2e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  30.48 
 
 
444 aa  134  2e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  25.52 
 
 
909 aa  135  2e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  26.46 
 
 
474 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  25.96 
 
 
450 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  24.31 
 
 
478 aa  134  4e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  25.92 
 
 
470 aa  134  4e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  25.7 
 
 
467 aa  132  1e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  26.17 
 
 
484 aa  132  1e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.36 
 
 
440 aa  132  1e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  27.31 
 
 
488 aa  132  1e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28.27 
 
 
458 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  26.11 
 
 
458 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.12 
 
 
407 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  24.71 
 
 
487 aa  130  5e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  28.46 
 
 
458 aa  130  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  26.04 
 
 
466 aa  130  7e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  25.29 
 
 
494 aa  129  9e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  28.88 
 
 
458 aa  129  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  27.18 
 
 
470 aa  129  1e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  25.55 
 
 
467 aa  129  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  28.27 
 
 
460 aa  129  1e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>