More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0346 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 431 aa  895    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  50.23 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  46.59 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  47.07 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  41.49 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  38.4 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  34.7 
 
 		 440 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  38.57 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  32.3 
 
 		 445 aa  236  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  38.07 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  37.28 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  34.99 
 
 		 417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  34.74 
 
 		 417 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  36.41 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  34.32 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  35.5 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  36.94 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  34.49 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  35.9 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  32.71 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  36.41 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  37.9 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  35.81 
 
 		 423 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  39.59 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  39.59 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  35.34 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  33.17 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  35.13 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  35.13 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  35.13 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  34.87 
 
 		 413 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  34.87 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  34.87 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  34.87 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  36.24 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  35.91 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  34.87 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0635  Glycine hydroxymethyltransferase  34.09 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  34.38 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  34.62 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  32.03 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  35.04 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  35.97 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  36.9 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  34.97 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  35.66 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2096  glycine hydroxymethyltransferase  34.17 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.835184  normal  0.0355089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  36.41 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  35.14 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  35.34 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  34.16 
 
 		 427 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  36.46 
 
 		 434 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.2 
 
 		 566 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  34.35 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  35.29 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  32.75 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  34.86 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  34.36 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  35.23 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  35.36 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 424 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  36.29 
 
 		 417 aa  193  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  33.59 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  34.03 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  35.53 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  34.14 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  34.55 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  35.07 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  35 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  34.77 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1626  Glycine hydroxymethyltransferase  34.33 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696145  normal  0.61537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3366  Glycine/serine hydroxymethyltransferase  34.29 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  34.48 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  35.45 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  35.26 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  33.83 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  33.85 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  33.69 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  35.03 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  35.03 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  34.34 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  34.18 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  34.52 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  34.52 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>