30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0169 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  100 
 
 		 452 aa  904    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  53.64 
 
 		 405 aa  458  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  52.67 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  51.32 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  46.65 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  45.49 
 
 		 426 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  47.99 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  40.04 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  41.56 
 
 		 438 aa  339  7e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  38.4 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  53.36 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  54.93 
 
 		 464 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  39.49 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  38.5 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  36.92 
 
 		 443 aa  285  8e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  37.25 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  47.75 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  36.06 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  37.18 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  49.62 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  33.12 
 
 		 477 aa  266  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  35.78 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  48.66 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  45.66 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  44.91 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  40.94 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  32.81 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  50 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  28.07 
 
 		 579 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  29.75 
 
 		 584 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>