More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0166 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 
799 aa  961  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
806 aa  1660  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  5.60387e-08  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
799 aa  976  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  6.48947e-14 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 
799 aa  980  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 
799 aa  972  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  42 
 
 
771 aa  626  1e-178  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
809 aa  506  1e-142  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
855 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
886 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
886 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
886 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
858 aa  473  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
865 aa  465  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
864 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
906 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
869 aa  458  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
865 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
886 aa  452  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
863 aa  449  1e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
863 aa  441  1e-122  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
816 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
865 aa  426  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
802 aa  423  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
808 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
908 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
905 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
808 aa  405  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
896 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
928 aa  399  1e-110  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
892 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.15 
 
 
836 aa  389  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
881 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
882 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.29696e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.42 
 
 
858 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
884 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 
845 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 
876 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
864 aa  372  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
877 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  31.67 
 
 
916 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.36 
 
 
886 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.62 
 
 
846 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
885 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 
874 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 
906 aa  365  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
881 aa  364  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.40435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  31.27 
 
 
881 aa  364  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  30.9 
 
 
865 aa  363  5e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
873 aa  363  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 
880 aa  363  7e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
860 aa  363  7e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
879 aa  363  9e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
865 aa  362  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
880 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  31.92 
 
 
861 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
901 aa  361  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 
894 aa  358  3e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 
855 aa  355  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
902 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 
881 aa  354  3e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
879 aa  354  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  31 
 
 
880 aa  354  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20164e-05  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
872 aa  349  9e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23734e-08 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
883 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
862 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
903 aa  347  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 
881 aa  347  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.51158e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
885 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69749e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1629  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
883 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
867 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 
895 aa  342  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
881 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.4278e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 
891 aa  339  1e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
882 aa  336  8e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  30.6 
 
 
925 aa  335  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
897 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 
892 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 
909 aa  335  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 
886 aa  335  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 
911 aa  333  5e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 
866 aa  332  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
909 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 
874 aa  330  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
918 aa  329  1e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
918 aa  328  2e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
918 aa  328  2e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 
909 aa  328  2e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 
884 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
886 aa  327  4e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  29.71 
 
 
887 aa  327  4e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0236  valyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 
879 aa  327  4e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 
892 aa  326  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
880 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 
885 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 
871 aa  323  9e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
929 aa  323  1e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
881 aa  322  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
883 aa  321  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
881 aa  321  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 
881 aa  320  8e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>