More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0113 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 413 aa  847    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  42.39 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  45.23 
 
 		 407 aa  368  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  46.6 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  45.36 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  43.46 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  43.56 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  45.71 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  44.44 
 
 		 409 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  43.42 
 
 		 407 aa  349  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  42.54 
 
 		 410 aa  348  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  41 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  42.72 
 
 		 421 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  40.71 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  40.85 
 
 		 411 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  37.84 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  37.84 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  37.16 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  38.02 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  37.93 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  38.42 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.45 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  28.99 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  27.89 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.44 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  27.82 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  26.89 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 		 395 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0688  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1192  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.05 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467708  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.765563  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.15 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.49 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.75 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  27.33 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  23.43 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.02 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  35.58 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.52 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  26.63 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1915  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  26.82 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.24 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  31.48 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  32.24 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.7 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.83 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.13 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1633  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.73321  normal  0.191724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.18 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  24.94 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  34.78 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  28.48 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.51 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  26.76 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  27.1 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  28.69 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.71 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.06 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.16 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  26.82 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.85 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  31.36 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.38 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  25.87 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0561  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.73 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  25.91 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0581  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.22 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680439  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.93 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.62 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.38 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.48 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.49 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.71 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.71 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.3 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  25.95 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  26.49 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.36 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.57 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  28.16 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.54 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  29.91 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.78 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  25.85 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  30.77 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>