More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0095 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 926 aa  1857    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.04 
 
 		 912 aa  663    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.58 
 
 		 916 aa  667    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.86 
 
 		 915 aa  677    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.98 
 
 		 916 aa  686    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  35.73 
 
 		 955 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.55 
 
 		 944 aa  562  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.66 
 
 		 932 aa  556  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  34.34 
 
 		 939 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.58 
 
 		 928 aa  541  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  34.24 
 
 		 943 aa  535  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37 
 
 		 927 aa  528  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.85 
 
 		 897 aa  522  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  34.29 
 
 		 954 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.49 
 
 		 970 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  35.68 
 
 		 898 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  34.31 
 
 		 946 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.8 
 
 		 928 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 		 937 aa  511  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  33.4 
 
 		 903 aa  510  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 		 909 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.57 
 
 		 972 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 		 903 aa  505  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 		 946 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 913 aa  492  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 		 905 aa  474  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.51 
 
 		 890 aa  464  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.62 
 
 		 913 aa  445  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 		 1688 aa  315  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 931 aa  305  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  31.69 
 
 		 888 aa  302  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.02 
 
 		 933 aa  301  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.27 
 
 		 1480 aa  295  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.91 
 
 		 874 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.91 
 
 		 874 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.01 
 
 		 874 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  29.7 
 
 		 875 aa  279  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  29.72 
 
 		 873 aa  279  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  29.18 
 
 		 870 aa  279  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.47 
 
 		 1502 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.55 
 
 		 1412 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  30.59 
 
 		 872 aa  275  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.31 
 
 		 1525 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  33.1 
 
 		 872 aa  272  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.08 
 
 		 1538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.08 
 
 		 1538 aa  271  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  29.2 
 
 		 1538 aa  270  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 		 1497 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  29.2 
 
 		 1538 aa  270  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1538 aa  270  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  30.04 
 
 		 1495 aa  270  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  29.08 
 
 		 1538 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  28.74 
 
 		 1538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  33.72 
 
 		 1448 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 1448 aa  266  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 1476 aa  266  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.64 
 
 		 1573 aa  261  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  32.72 
 
 		 1515 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  31.81 
 
 		 1435 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 1534 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.78 
 
 		 1505 aa  255  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.15 
 
 		 1518 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  32.22 
 
 		 1388 aa  254  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 		 1508 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.74 
 
 		 915 aa  252  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.38 
 
 		 1480 aa  252  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.83 
 
 		 1510 aa  251  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 		 1451 aa  251  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 1429 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  31.33 
 
 		 1536 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.72 
 
 		 1626 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 1426 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  28.65 
 
 		 828 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.44 
 
 		 1700 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  32.44 
 
 		 1599 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.99 
 
 		 1514 aa  247  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.74 
 
 		 1434 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.44 
 
 		 1598 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  28.31 
 
 		 1531 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  32.55 
 
 		 1598 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.44 
 
 		 1598 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  32.44 
 
 		 1598 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.44 
 
 		 1598 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  31.19 
 
 		 1536 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  32.2 
 
 		 1419 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29 
 
 		 1523 aa  245  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  30.89 
 
 		 1536 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  32.6 
 
 		 1504 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.27 
 
 		 1517 aa  244  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  28.68 
 
 		 1493 aa  244  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  32.56 
 
 		 1534 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 828 aa  243  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  30.03 
 
 		 1431 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 		 828 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  27.82 
 
 		 1506 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 801 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 900 aa  241  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.11 
 
 		 922 aa  240  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  28.35 
 
 		 1523 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1523 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>