109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0068 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  892    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  38.11 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  33.25 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2167  nodulation efficiency protein NfeD  36.03 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  35.59 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  32.94 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  32.4 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  28.77 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  29.53 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  28.67 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  31.99 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  29.7 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  32.09 
 
 		 501 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  30.22 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  31 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  25.89 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  31.85 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  29.06 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  32.82 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  31.52 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  27.16 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  29.6 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  28.87 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  28.33 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  28.72 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  28.27 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  26.76 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  27.3 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  28.04 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  28.85 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  26.12 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  26.3 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  28.31 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  29.24 
 
 		 462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  28.14 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  28.85 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  29.82 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  29.64 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  27.1 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  26.06 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  27.12 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  27.1 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  29.08 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  27.69 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  28.68 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  27.61 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  28.33 
 
 		 453 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  28.06 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  27.91 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  29.17 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  28.71 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  27.67 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  29.34 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  33.07 
 
 		 468 aa  103  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  31.35 
 
 		 486 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  26.2 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1395  hypothetical protein  33.97 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51965  normal  0.883409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  27.4 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  26.45 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  27.95 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  28.95 
 
 		 510 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  27.13 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  30.61 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  27.96 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  28.71 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  27.34 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  28.62 
 
 		 467 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  26.53 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  24.94 
 
 		 501 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  24.09 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  25.67 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  26.16 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  27.17 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  26.2 
 
 		 500 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  25.34 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  25.6 
 
 		 557 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  26.94 
 
 		 488 aa  87.4  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  27.34 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  26.51 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  26.8 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  24.27 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  24.04 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  24.71 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  23.74 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  22.77 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  26.1 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  22.61 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  27.58 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  26.22 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  23.17 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  22.14 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  22.14 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0037  nodulation efficiency protein NfeD  27 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  25.91 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  21.97 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0012  protein of unknown function DUF107  46.55 
 
 		 124 aa  57  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  24.08 
 
 		 522 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  24.35 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>