More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0063 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1139  ferredoxin-dependent glutamate synthase  85.5 
 
 
463 aa  825    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0063  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
463 aa  930    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0906024  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0458  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.74 
 
 
461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000334759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0142  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.46 
 
 
461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.191381  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0045  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.52 
 
 
529 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1218  hypothetical protein  29.74 
 
 
547 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0505  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.38 
 
 
546 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000290949  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1693  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.17 
 
 
532 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1750  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.63 
 
 
532 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2028  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.98 
 
 
529 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.99 
 
 
545 aa  99.8  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000061126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0402  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.27 
 
 
546 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.441751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0305  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.78 
 
 
522 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000055557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2809  glutamate synthase-like protein  29.95 
 
 
525 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1508  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.39 
 
 
532 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2289  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.52 
 
 
545 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1424  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.79 
 
 
547 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2628  glutamate synthase-related protein  26.05 
 
 
530 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1179  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.37 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368179  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3762  glutamate synthase-related protein  28.64 
 
 
525 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000234985  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2034  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.7 
 
 
529 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2665  hypothetical protein  28.92 
 
 
544 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2029  glutamate synthase-like protein  28.85 
 
 
525 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000270819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16450  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.48 
 
 
545 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000101373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  26.52 
 
 
500 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.35 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2266  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.73 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  25.51 
 
 
503 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.43 
 
 
507 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.71 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4067  ferredoxin-dependent glutamate synthase  24.71 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  26.64 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.76 
 
 
503 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.22 
 
 
510 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  26.54 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  33.69 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  33.69 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  27.76 
 
 
507 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  26.04 
 
 
500 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  33.16 
 
 
503 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1344  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 
441 aa  77  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.45 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  26.69 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.75 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.91 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  25.76 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  25.86 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  31.08 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  25.76 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  27.97 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  31.5 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.99 
 
 
529 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1136  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.8 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4697  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.75 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  31.5 
 
 
507 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6006  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.76 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.762875  hitchhiker  0.00902062 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.64 
 
 
529 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4804  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.89 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.375524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5512  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.09 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0459  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.44 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.982817  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  22.35 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.69 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.38 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2250  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.08 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.63 
 
 
581 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2585  glutamate synthase family protein  27.88 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00726879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3465  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.88 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.57505  normal  0.540858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.05 
 
 
543 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3293  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.76 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.24 
 
 
543 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6577  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.76 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0337606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1868  putative glutamate synthase large subunit-like protein  26.01 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.553438  normal  0.798632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.82 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2276  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.88 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574266  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1944  putative large subunit of glutamate synthase  25.62 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.438663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.09 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.38 
 
 
1510 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  27.11 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.56 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1322  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.92 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3522  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25.59 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0650047 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.28 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2501  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  26.29 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.267464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  30.54 
 
 
540 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  26.67 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  29.69 
 
 
1533 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  22.8 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2018  ferredoxin-dependent glutamate synthase  23.49 
 
 
472 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  26.73 
 
 
600 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.78 
 
 
541 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4808  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.11 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0816928  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5445  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.17 
 
 
1536 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  31.49 
 
 
536 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5751  glutamate synthase large subunit  25.35 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.27 
 
 
543 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  29.69 
 
 
1527 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.73 
 
 
577 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  23.39 
 
 
741 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2634  ferredoxin-dependent glutamate synthase  25 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5154  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.17 
 
 
1527 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.631687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>