199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0059 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  100 
 
 
156 aa  317  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  59.85 
 
 
140 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  55.64 
 
 
143 aa  152  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  55.07 
 
 
144 aa  152  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  57.14 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  57.14 
 
 
140 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  57.14 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  57.58 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  57.58 
 
 
140 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  54.41 
 
 
146 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  54.89 
 
 
140 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  53.68 
 
 
146 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  56.82 
 
 
140 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  53.33 
 
 
144 aa  147  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  54.55 
 
 
139 aa  147  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  54.89 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  54.89 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  54.89 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  56.06 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  54.96 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  56.06 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  54.96 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  54.55 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  54.2 
 
 
140 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  53.03 
 
 
139 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  53.03 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  53.03 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  53.03 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  46.53 
 
 
196 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  44.62 
 
 
178 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  48.03 
 
 
179 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  48.03 
 
 
179 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  45.67 
 
 
167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  46.92 
 
 
178 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  41.18 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  44 
 
 
178 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  45.31 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  45.77 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  44.93 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.31 
 
 
237 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  45.26 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.71 
 
 
237 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  40.52 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  37.42 
 
 
237 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  39.86 
 
 
190 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  43.31 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  43.28 
 
 
191 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.67 
 
 
179 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  44.27 
 
 
180 aa  94  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  40.65 
 
 
194 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  43.18 
 
 
191 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  42.55 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.67 
 
 
237 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  43.31 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.85 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  43.7 
 
 
191 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  43.18 
 
 
696 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  43.07 
 
 
197 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.67 
 
 
221 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  44.36 
 
 
190 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  42.03 
 
 
191 aa  91.7  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  43.18 
 
 
696 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  42.86 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.64 
 
 
178 aa  91.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  41.98 
 
 
191 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.64 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  44.14 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  42.19 
 
 
172 aa  90.1  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  41.98 
 
 
191 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  38.71 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  40.46 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  41.04 
 
 
190 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  37.96 
 
 
192 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  41.18 
 
 
192 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  40.15 
 
 
191 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  35.84 
 
 
243 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  40.31 
 
 
181 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  37.25 
 
 
194 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  40.85 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  42.06 
 
 
166 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  41.48 
 
 
190 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.29 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  35.06 
 
 
235 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  37.75 
 
 
194 aa  89  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  37.78 
 
 
191 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  38.26 
 
 
191 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  41.73 
 
 
179 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  40.8 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  38.69 
 
 
164 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.06 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  41.13 
 
 
191 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  41.22 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>