More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0049 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  100 
 
 		 560 aa  1094    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  48.57 
 
 		 589 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  47.07 
 
 		 592 aa  518  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2321  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 582 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 582 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 596 aa  503  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  45.44 
 
 		 608 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 573 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 		 581 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1253  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 562 aa  476  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0518  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3504  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 570 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  43.07 
 
 		 576 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1651  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 641 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695517  normal  0.0730929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1554  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0565  major facilitator transporter  42.88 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0577  major facilitator superfamily transporter  42.88 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.410817  decreased coverage  0.00469629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0555  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0084  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 589 aa  390  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0483176  normal  0.0703431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.72 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.03 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.04 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.16 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.71 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 487 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.06 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.78 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 528 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.54 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 477 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 461 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 534 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 477 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  27.31 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  27.79 
 
 		 513 aa  154  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  27.79 
 
 		 513 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.79 
 
 		 513 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 513 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 467 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  26.33 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  27.45 
 
 		 507 aa  153  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4579  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.59 
 
 		 513 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 532 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.5 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 482 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.35 
 
 		 521 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 537 aa  146  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 479 aa  144  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.77 
 
 		 515 aa  144  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 621 aa  143  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 478 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 525 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  31 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>