More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0044 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  52.21 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  48.87 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  42.02 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  45.87 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  38.93 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  45.71 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  36.29 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  45.63 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40.95 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  40.2 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  42.99 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.27 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  39.05 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  45.16 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  41.35 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  41.35 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  35.66 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  43.27 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  32.54 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  37.04 
 
 		 109 aa  94  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  40.43 
 
 		 114 aa  94  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  37.86 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  36.27 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  36.36 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  38.3 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  35 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  45.56 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  42.72 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  38.68 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.95 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  38.68 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  37.14 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.54 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  41.75 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  41.9 
 
 		 223 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  45.16 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.78 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  43.14 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  40.21 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  45.16 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  36.45 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  39.05 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  41.9 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  41.9 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  43.27 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  32.56 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  45.68 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.82 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  38.24 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  43.27 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  36.79 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  33.96 
 
 		 286 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  40 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0588  thioredoxin  30.3 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.99153  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  38.1 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  38.83 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  37.21 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  38.32 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  42.55 
 
 		 108 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  33.83 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  34.33 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  43.3 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  36.54 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  37.74 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  41.58 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  37.74 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  35.92 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  36.59 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  41.94 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  40.38 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  36.79 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  42.27 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>