100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0033 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1411  extracellular solute-binding protein  54.06 
 
 
791 aa  694    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1189  extracellular solute-binding protein  52.92 
 
 
793 aa  659    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.109434  hitchhiker  0.000120302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1161  extracellular solute-binding protein  57.65 
 
 
775 aa  744    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0033  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
781 aa  1546    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.649183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0552  extracellular solute-binding protein  53.36 
 
 
788 aa  685    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.295853 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0389  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 
810 aa  648    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000267846  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1315  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 
788 aa  543  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0875  extracellular solute-binding protein  45.43 
 
 
774 aa  531  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0232  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 
787 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0778  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
778 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1424  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 
779 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0120501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0654  extracellular solute-binding protein  46.13 
 
 
810 aa  462  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0507861  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0600  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 
790 aa  425  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  39.54 
 
 
794 aa  389  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1848  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 
821 aa  331  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0617  extracellular solute-binding protein family 5  29.44 
 
 
596 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  24.63 
 
 
675 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0482  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 
693 aa  78.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.181954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
557 aa  77.8  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4466  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 
607 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  24.19 
 
 
545 aa  68.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0050  extracellular solute-binding protein family 5  24.48 
 
 
628 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600017  normal  0.630489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1494  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
716 aa  65.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.580792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4518  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
615 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.872953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 
569 aa  64.7  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0487  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183361  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  29.14 
 
 
565 aa  62  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 
535 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
627 aa  61.6  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 
554 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
551 aa  60.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  21.77 
 
 
735 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1796  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
616 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000801458  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0685  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
682 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.025918 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  24.71 
 
 
557 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 
547 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
560 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  22.28 
 
 
580 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 
587 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.58 
 
 
556 aa  55.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 
539 aa  53.9  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 
620 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.52 
 
 
638 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2600  extracellular solute-binding protein family 5  24.59 
 
 
500 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2987  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.59 
 
 
543 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4095  extracellular solute-binding protein family 5  24.72 
 
 
567 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  29.46 
 
 
560 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.74 
 
 
587 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.78 
 
 
540 aa  52  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
597 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 
621 aa  52  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
636 aa  51.6  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
626 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  31.46 
 
 
560 aa  51.2  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 
559 aa  51.2  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
544 aa  51.2  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 
634 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4448  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 
604 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0796  extracellular solute-binding protein family 5  23.53 
 
 
722 aa  48.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.963873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
531 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  21.94 
 
 
577 aa  48.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  22.08 
 
 
537 aa  48.1  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
576 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
514 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
559 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4449  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
604 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.21 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
534 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
534 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  21.68 
 
 
532 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
579 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
531 aa  46.6  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
531 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
531 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2585  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 
603 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  21.69 
 
 
557 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 
553 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1816  peptide transport periplasmic protein SapA  27.32 
 
 
549 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.440252  hitchhiker  0.00000000112139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1305  extracellular solute-binding protein family 5  25.74 
 
 
693 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1817  peptide transport periplasmic protein SapA  27.32 
 
 
549 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.690019  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1640  peptide transport periplasmic protein SapA  27.32 
 
 
549 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000341731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
512 aa  45.8  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 
565 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
524 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4447  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
604 aa  45.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0329376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1619  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
633 aa  45.4  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00276535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
510 aa  45.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 
634 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 
529 aa  44.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  22.05 
 
 
561 aa  44.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 
531 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
507 aa  44.3  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  21.51 
 
 
534 aa  44.3  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>