More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0019 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 336 aa  674    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  64.56 
 
 		 334 aa  451  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  64.86 
 
 		 334 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  63.36 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  60.24 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  56.02 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  51.95 
 
 		 333 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  46.13 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  46.15 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  46.13 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  42.73 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  42.99 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  43.28 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  42.09 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  44.14 
 
 		 337 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.36 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  35.53 
 
 		 561 aa  185  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  34.92 
 
 		 507 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  36.54 
 
 		 550 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  36.01 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  34.82 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  30.9 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  29.23 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1304  adenylosuccinate synthetase  34.63 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  29.49 
 
 		 444 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  30.36 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  30.86 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 425 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  28.99 
 
 		 435 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.66 
 
 		 432 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  28.94 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  29.95 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  29.04 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  29.16 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  28.74 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  28.74 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  27.93 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  28.71 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  29.93 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  28.99 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  30.07 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  29.22 
 
 		 446 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1068  adenylosuccinate synthetase  30.62 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  28.6 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  30.4 
 
 		 438 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  29.22 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  29.22 
 
 		 446 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  29.47 
 
 		 435 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  28.84 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00089  adenylosuccinate synthetase  29.93 
 
 		 438 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  29.5 
 
 		 434 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.91 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  29.31 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  29.67 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  28.64 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  29.95 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  30.95 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  32.44 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  29.57 
 
 		 427 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  29.83 
 
 		 427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  29.4 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  30.22 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  29.38 
 
 		 429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  30.19 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0966  Adenylosuccinate synthase  29.67 
 
 		 432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  28.54 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  31.76 
 
 		 449 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>