More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0007 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  75.75 
 
 		 553 aa  780    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  76.7 
 
 		 558 aa  803    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  100 
 
 		 558 aa  1115    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  75.33 
 
 		 554 aa  788    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  63.74 
 
 		 545 aa  676    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  75.94 
 
 		 560 aa  803    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  58.99 
 
 		 559 aa  632  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  59.96 
 
 		 562 aa  629  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  57.03 
 
 		 557 aa  590  1e-167  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  57.17 
 
 		 553 aa  589  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  55.83 
 
 		 548 aa  570  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  51.87 
 
 		 570 aa  565  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  54.24 
 
 		 554 aa  561  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  55.81 
 
 		 549 aa  549  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  55.64 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  56.02 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  51.4 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  51.41 
 
 		 553 aa  537  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  49.81 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  49.91 
 
 		 539 aa  533  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  51.51 
 
 		 551 aa  528  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  49.15 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  48.77 
 
 		 542 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  47.46 
 
 		 543 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  47.6 
 
 		 543 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.06 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  47.45 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  47.09 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  46.58 
 
 		 560 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  48.3 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  48.46 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  46.36 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  46.33 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  46.17 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  45.98 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  46.49 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  44.38 
 
 		 559 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  45.01 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  47.73 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  43.27 
 
 		 563 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  43.73 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  42.53 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.19 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  43.93 
 
 		 500 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  42.5 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.45 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  39.52 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  41.13 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  38.93 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.57 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.71 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.08 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  40.8 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  37.76 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  37.76 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  36.18 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  39.93 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  39.44 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  39.37 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.05 
 
 		 555 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  39.78 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  41.46 
 
 		 548 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  38.75 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.19 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  35.7 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  36.93 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.96 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  39 
 
 		 535 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.4 
 
 		 519 aa  354  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  35.66 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.67 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  38.91 
 
 		 528 aa  347  4e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40 
 
 		 527 aa  346  7e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  39.07 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  39.18 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  34.66 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  37.89 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.14 
 
 		 542 aa  340  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  36.11 
 
 		 551 aa  339  9e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  36.5 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  37.5 
 
 		 533 aa  332  9e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  34.02 
 
 		 542 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.66 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  35.06 
 
 		 568 aa  325  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.32 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  33.02 
 
 		 560 aa  319  9e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  33.09 
 
 		 577 aa  306  7e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  35.74 
 
 		 558 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  35.3 
 
 		 552 aa  300  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  31.18 
 
 		 563 aa  300  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  35.04 
 
 		 531 aa  296  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  36.24 
 
 		 534 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  36.24 
 
 		 534 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  34.87 
 
 		 527 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  33.98 
 
 		 523 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  32.82 
 
 		 541 aa  286  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03610  t-complex protein 1, theta subunit (tcp-1-theta), putative  35.42 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  33.85 
 
 		 546 aa  276  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  33.46 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.470693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>