16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0004 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  100 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  43.96 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  38.53 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  38.71 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  36.05 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  35.63 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  32.22 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  30.61 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  31.87 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  31.11 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  30 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  30 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  31.11 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  28.42 
 
 		 99 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>