10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0001 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0001  hypothetical protein  100 
 
 
2938 aa  5695    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0034  hypothetical protein  26.97 
 
 
2661 aa  141  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1111  hypothetical protein  27.71 
 
 
2656 aa  132  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0072  hypothetical protein  26.4 
 
 
2667 aa  127  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0064  hypothetical protein  26.7 
 
 
2676 aa  125  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.795538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1501  hypothetical protein  30.99 
 
 
423 aa  116  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.318324 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0920  hypothetical protein  35.25 
 
 
210 aa  63.9  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0168777 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2015  hypothetical protein  29.5 
 
 
215 aa  60.5  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000606511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0003  hypothetical protein  30.08 
 
 
207 aa  58.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.62536  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1030  hypothetical protein  32.23 
 
 
208 aa  58.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.381943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>