61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_R0034 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0899378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0028  tRNA-Val  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0029  tRNA-Val  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t24  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15450  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0490498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0033  tRNA-Val  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00270  tRNA-Val  96.55 
 
 		 105 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08020  tRNA-Val  96.55 
 
 		 103 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0048  tRNA-Val  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0049  tRNA-Val  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0018  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309042  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0564  tRNA-Met  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0030  tRNA-Met  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0174  tRNA-Met  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453072  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>