170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2454 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
321 aa  655    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  81.93 
 
 
316 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  72.59 
 
 
321 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  71.88 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  71.25 
 
 
321 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  66.56 
 
 
321 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  66.98 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  66.98 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  66.67 
 
 
321 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  66.36 
 
 
321 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  66.67 
 
 
321 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  66.14 
 
 
327 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  64.26 
 
 
319 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  62.7 
 
 
321 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  55.9 
 
 
324 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  56.43 
 
 
325 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  54.86 
 
 
506 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  54.43 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  55.97 
 
 
321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  54.4 
 
 
336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  54.69 
 
 
327 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  55.49 
 
 
323 aa  351  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  54.01 
 
 
325 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  54.55 
 
 
325 aa  348  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  52.04 
 
 
320 aa  334  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  56.95 
 
 
295 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  51.86 
 
 
333 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  53.02 
 
 
288 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  43.08 
 
 
340 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  42.95 
 
 
335 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  76.82 
 
 
160 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  40.57 
 
 
338 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  41.14 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  39.12 
 
 
334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  37.9 
 
 
326 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  38.24 
 
 
323 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  40.69 
 
 
323 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  80.61 
 
 
112 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  48.82 
 
 
180 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  43.86 
 
 
176 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  28.71 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  33.74 
 
 
318 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  30.56 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  72.62 
 
 
97 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  67.39 
 
 
101 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.15 
 
 
319 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  30.8 
 
 
321 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  33.05 
 
 
316 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  76.92 
 
 
81 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  31.3 
 
 
314 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  29.3 
 
 
315 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.14 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  32.14 
 
 
305 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.59 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  27.71 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  33.52 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  35.09 
 
 
252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.63 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  29.91 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  52.48 
 
 
101 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.05 
 
 
258 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  27.22 
 
 
321 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 
289 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  31.56 
 
 
239 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 
289 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  34.1 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  69.01 
 
 
72 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  27.64 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  32.37 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  27.14 
 
 
253 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  36.36 
 
 
241 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  34.08 
 
 
277 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  34.24 
 
 
231 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  35.42 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  32.04 
 
 
232 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.87 
 
 
288 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 
287 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  31.87 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.34 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  31.32 
 
 
288 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  25.4 
 
 
323 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  27.06 
 
 
241 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  36.99 
 
 
235 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.28 
 
 
236 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  32.52 
 
 
236 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  28.57 
 
 
287 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  28.65 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  28.65 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  34.59 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  34.59 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  29.81 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  32.91 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  31.25 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  27.75 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  30.16 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  31.72 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  29.61 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  34.27 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  27.85 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>